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罗氏沼虾白斑综合征病毒囊膜蛋白VP28基因的克隆及分析
  • ISSN号:1000-6907
  • 期刊名称:《淡水渔业》
  • 时间:0
  • 分类:S945.4[农业科学—水产养殖;农业科学—水产科学] Q958.83[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]苏州大学生命科学学院,江苏苏州215123, [2]江苏省水生动物疫病控制中心,南京210036, [3]苏州市水产研究所有限公司,江苏苏州215107
  • 相关基金:苏州市攻关课题(SNZ0518);国家973项目(2005CB121000)
中文摘要:

根据已公布的罗氏沼虾白斑综合征病毒(WSSV)囊膜蛋白VP28基因序列设计一对特异性引物,从疑似患白斑病毒病的罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)中提取总DNA,并以此为模板,经PCR扩增、克隆并测序后将该片段通过GenBank比对,证实为WSSV的VP28基因;与20个已公布的WSSVVP28进行同源性比较,结果显示:从中国对虾、斑节对虾、南美自对虾、日本对虾、波纹龙虾提取的病毒株聚为一类,印度对虾WSSVVP28为另一类,罗氏沼虾WSSVVP28又单独为一类。根据测序结果推测VP28蛋白的二级结构在氨基酸的7~29区间可能为跨膜螺旋区,且该区域高度保守。

英文摘要:

A special pair of primers was designed based on white spot syndrome virus (WSSV) released from GenBank to amplify a fragment with total DNA template from Macrobrachium rosenbergii which was suspicious of being infected with WSSV. Then the fragment was cloned and sequenced. Blast analysis indicates the fragment belongs to VP28 of WSSV. Compared the WSSV VP28 gene from M. rosenbergii with twenty published ones on GenBank and devised the dendrogram. The result showed that the virus from Penaeus Chinensis, P. monodon, P. setiferus, P. japonicus, and P. homarus were congeneric. The one from P. indicus was another genus, and the one from M. rosenbergii was different. The membrane helix from 7 to 29 was predicted according to the amino acid sequence of VP28, and it was highly reserved.

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期刊信息
  • 《淡水渔业》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国水产学会 中国水产科学研究院长江水产研究所 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
  • 主编:陈大庆
  • 地址:湖北省武汉市东湖新技术开发区武大园一路8号
  • 邮编:430223
  • 邮箱:dsyy@chinajournal.net.cn
  • 电话:027-81780185
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6907
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1138/S
  • 邮发代号:38-32
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11619