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家蚕丝腺组织高丰度表达基因BmeIF5A的克隆和进化分析
  • ISSN号:0257-4799
  • 期刊名称:《蚕业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S881.2[农业科学—特种经济动物饲养;农业科学—畜牧兽医] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]西南大学蚕学与生物技术学院、农业部蚕桑学重点开放实验室,重庆400716, [2]重庆师范大学生命科学学院,重庆400715
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划“973”项目(编号2005CB121000);重庆市自然科学基金项目(编号9067).
中文摘要:

从家蚕丝腺组织克隆得到2种mRNA形式的家蚕B脚胛A基因(GenBank登陆号:DQ202521;DQ201182),虽都具有相同的编码160个氨基酸的编码区,但却为不同长短的3’非编码区(3’UTR)。家蚕BmeIF5A基因包含3个外显子和2个内含子。组织表达谱分析发现该基因在丝腺组织里高丰度表达。分析推导的氨基酸序列揭示该基因产物具有eIF5A家族蛋白质共有的保守区。序列同源性分析表明eIF5A家族基因在所有的真核生物中都高度保守。进化生物学的分析显示家蚕的eIF5A基因与昆虫的同源性较高。

英文摘要:

The animo acid sequence of Drosophila eIF5A was searched against the silkworm EST database with tBLASTn program. The ESTs with high score were clustered and assembled to a consensus sequence. We cloned and indentified a gene in Bombyx mori using the primers based on the consensus sequence from assembly, termed it as BmeIF5A-1 (GeneBank accession number: DQ202521 ). We also cloned and identified the gene in silkworm using the protocol of 3'rapid amplification of cDNA ends(3'RACE),termed it as BmeIF5A-2( GeneBank accession number. DQ201182). It had the same ORF as the BmeIF5A-1, but a poly (A) tail. These results of the structure of the BmeIF5A-1 and BmeIF5A-2 indicated that BmeIF5A gene is likely to contain two transcriptional types and different length of 3'untranslated region. The BmeIF5A gene was abundant in silkgland tissue in the silkworm. An alignment of the coding sequence with the silkworm genome sequences revealed that there were 3 exons in BmeIF5A. The deduced amino acid sequence of the BmeIF5A shaned a conservative domain harbored in a 12 amino acid sequence(STSKTGKHGHAK). It showed that the silkworm eIF5A protein was conserved in almost eukaryotes comparing with other species. The phylogenetic analysis showed a higher conservation of the silkworm BmeIF5A with the Arthropoda.

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期刊信息
  • 《蚕业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国蚕学会 中国农业科学院蚕业研究所
  • 主编:郭锡杰
  • 地址:江苏省镇江市四摆渡中国农业科学院蚕业研究所
  • 邮编:212018
  • 邮箱:CYKE@chinajournal.net.cn
  • 电话:0511-85616835
  • 国际标准刊号:ISSN:0257-4799
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1115/S
  • 邮发代号:28-23
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊,全国农业学会优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:7742