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家蚕细胞凋亡相关基因BmICAD的克隆、序列和功能分析及其在精巢中特异表达的初步研究
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:Q953[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]西南大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点实验室,重庆400716
  • 相关基金:国家973重点项目(编号;2005CB121000),国家自然科学基金项目(编号;3033046,30471313)资助
中文摘要:

DREP-1基因在果蝇的细胞凋亡过程中对DNA的降解有重要调控作用。本研究将该基因序列在家蚕EST数据库中进行同源性检索,把检索到的EST序列进行电子延伸和克隆重叠群拼接,根据拼接结果设计引物进行PCR扩增并克隆测序验证,首次成功克隆了家蚕第一个ICAD基因BmICAD的cDNA:该cDNA全长844bp,ORF长522bp,编码含有174个氨基酸的蛋白;预测分子量为19.6kDa,等电点为4.23,所编码蛋白与果蝇DREP-1的一致性(identity)为36%;虽然Northern印记杂交未检测到信号,但是RT-PCR结果显示,该基因在精巢中特异表达。

英文摘要:

The DREP-1 gene plays an important role in the process of apoptosis in Drosophila. The amino acid sequence of Drosophilo ICAD was searched against the silkworm EST database. The resulted ESTs were clustered and assembled into a consensus sequence. Primers based on the consensus sequence were designed and the full length cDNA of ICAD gene, designated BmICAD, was cloned firstly from Bombyx mori. This BmICAD cDNA was 844 bp in length, containing a 522 bp open reading frame (ORF), which encoded a protein of 174 amino acids; the molecular weight of this protein was estimated to be 19.6 kD and the isoelectric point was 4.23. The BmICAD protein shares 36% identity with Drosophila DREP-1. No signal has inspected by Northern blot, but RT-PCR analysis showed that BmICAD was testis-specific expressed at the mRNA level. Structure and clustering analysis indicated that this gene might be involved in the process of apoptosis that regulated the degradation of DNA.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270