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BPIV-3和BVDV双重RT-PCR快速检测方法的建立
  • ISSN号:1007-5038
  • 期刊名称:《动物医学进展》
  • 时间:0
  • 分类:S852.653[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]华中农业大学农业微生物学国家重点实验室,湖北武汉430070, [2]华中农业大学动物医学院,湖北武汉430070, [3]华中农业大学动物科技学院,湖北武汉430070
  • 相关基金:公益性行业(农业)科研专项基金(201003060); 现代农业(肉牛)产业技术体系(nycytx-38)建设专项基金
中文摘要:

参照GenBank中登录的牛副流感病毒3型(BPIV-3)和牛病毒性腹泻病毒(BVDV)全基因序列,分别针对BPIV3特异性NP蛋白保守基因和BVDV保守区段E2基因设计2对引物,经优化反应条件建立了快速鉴别BPIV-3和BVDV的双重RT-PCR诊断方法。最佳扩增条件为94℃30s,56.2℃30s,72℃1min,循环30次;72℃延伸5min,16℃10min;BVDV引物浓度为1.0μmol/L,BPIV-3引物浓度为0.5μmol/L。采用该方法检测BPIV-3和BVDV参考病毒株,能同时扩增出预期为425bp和294bp大小的特异性片段,而扩增牛传染性鼻气管炎病毒、牛合胞体病毒、猪瘟病毒以及牛支原体、致病性大肠埃希菌、多杀性巴氏杆菌A型、化脓隐秘杆菌和鼠伤寒沙门菌等均呈阴性反应。对参考病毒株进行梯度稀释检测,结果证明该方法检测BPIV-3的灵敏度可达10^-3 TCID50/0.1mL,而BVDV的灵敏度达102 TCID50/0.1mL。

英文摘要:

With primers specific to nucleotide sequences of bovine parainfluenza virus 3(BPIV-3) NP gene and bovine viral diarrhea virus(BVDV) E2 gene from GenBank,the duplex RT-PCR method for bovine parainfluenza virus 3 and bovine viral diarrhea virus detection was developed.The optimum condition is as followings: 94 ℃30 s,56.2 ℃30 s,72 ℃1 min for 30 cycle,72 ℃ 5 min,16 ℃ 10 min;BVDV primer concentration of 1 μmol /L,BPIV-3 primer concentration of 0.5 μmol /L.By using this method,the specific fragment of 425 bp was amplified from BPIV-3 samples while that of 294 bp from BVDV.None target fragments were amplified from bovine respiratory syncytial virus(BRSV),infectious bovine rhinotracheitis virus(IBRV) and classical swine fever virus(CSFV),Mycoplasma bovis strain HB0801,Esche richia coli,Pasteurella coli type A and rat typhoid Salmonella.By this method,a minimal sample of 10^-3 TCID50 /0.1 mL could be detected from BPI^-3,minimal sample of 10^2 TCID50 /0.1 mL could be detected from BVDV.

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期刊信息
  • 《动物医学进展》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学
  • 主编:张彦明
  • 地址:西北农林科技大学畜牧兽医学院
  • 邮编:712100
  • 邮箱:dyjzyilan@263.net
  • 电话:029-87092574
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-5038
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1306/S
  • 邮发代号:52-60
  • 获奖情况:
  • 陕西省优秀科技期刊奖,全国畜牧兽医优秀期刊奖,《CAJ-CD规范》执行优秀奖,畜牧兽医类核心期刊,中国农业核心期刊,陕西省优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:19330