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基于苹果EST-SSR的梨种质资源遗传多样性分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学园艺学院,南京210095, [2]江苏省农业科学院园艺研究所,南京210014
  • 相关基金:国家公益性行业(农业)科研专项(200903044)
中文摘要:

利用来自苹果的8对EST-SSR标记对48份梨(Pyrus)种质资源进行遗传多样性研究,以分析其在梨属植物上的通用性。结果表明,8对EST-SSR引物在供试材料上均能扩增出与苹果大小相似的产物,所有引物共检测到140个基因位点,其中多态性位点129个,多态性比例为92.14%,并且可成功区分不同品种。根据EST-SSR标记所揭示的多态性和UP-GMA法聚类分析,48份梨种质资源在相似系数0.62处可分为东方梨和西方梨两个种群,而中国的白梨(Pyrus bretschneideriRehd.)、砂梨(P.pyrifoliaBurm.f.Nakai)和秋子梨(P.ussuriensisMax-im.)相互交错在一起,没有独自成组。可见,苹果的EST-SSR标记在梨上具有高度的可转移性,可应用于梨属植物的资源评价及遗传关系研究。

英文摘要:

Eight simple sequence repeat markers derived from expressed sequence tags(EST-SSR markers) of apple(Malus pumila) were selected for analysis their application on genetic diversity among 48 cultivars in pear(Pyrus).The results showed that eight EST-SSR primer pairs gave an amplification product when tested on all pear cultivars,and the size of amplification bands were similar to those of apple.In this study,140 gene locus were screened by all EST-SSR,of which 129(92.14%) were polymorphic,and different cultivars could be distinguished successfully.Therefore,EST-SSR markers developed from apple showed high transferability in pear,and it would be suitable for application in germplasm evaluation and genetic relationship analysis of pear.Based on polymorphism revealed by EST-SSR markers,UPGMA cluster analysis was performed by software NTY-SIS-pc2.01,the clades formed two populations,oriental and occidental population,at the dice coefficient of 0.62.Pyrus bretschneideri Rehd.,P.ussuriensis Maxim.and P.pyrifolia Burm.f.Nakai originated in China intervened each other and could not form group independently.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104