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双胚苗水稻SARⅡ-628的自然同源三倍化和DNA甲基化
  • ISSN号:1001-7216
  • 期刊名称:中国水稻科学
  • 时间:0
  • 页码:469-474
  • 语言:中文
  • 分类:Q943[生物学—植物学] S511.01[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]四川农业大学水稻研究所,四川温江611130, [2]四川农业大学西南作物基因资源与遗传改良教育部重点实验室,四川雅安625014
  • 相关基金:教育部长江学者和创新团队发展计划资助项目(IRT0453);四川省青年基金资助项目.
  • 相关项目:几个特异基因家族在不同倍性水稻中的表达差异研究
中文摘要:

从4500对SARⅡ-628的双胚苗中筛选出5对二倍体-三倍体双胚苗。SSR分析显示它们在所检测的310个位点上没有差异。以AFLP为基础的MSAP(methylation-sensitive AFLP)研究显示,5个二倍体在493个位点上甲基化状态没有差异。与二倍体比较,相应的三倍体虽然在甲基化总体水平上变化不大,但共有29个位点甲基化类型在不同单株上发生了变异,表明SARⅡ-628自然同源三倍化后甲基化变异在M0代就迅速发生。变异共有10种类型,包括甲基化程度上升、下降各3种类型以及不定类型4种。对其中22个位点测序检索显示:这些甲基化变异涉及整个水稻基因组的12对染色体且具有位点特异性,不同单株的变异位点各不相同,预示着SARⅡ-628不同单株在自然同源三倍化后将走向不同的命运。

英文摘要:

A total of 5 pairs of diploid triploid twin-seedlings were selected from 4500 pairs of SARⅡ-628 twin-seedlings. SSR analysis showed that there was no difference on 310 detected sites. A modified AFLP technique MSAP (methylation-sensitive AFLP) was employed to analyze methylation mutation. Although no methylation mutation was found in the 5 diploids, 29 methylation mutation sites were found in the corresponding triploids, which indicated that methylation mutation happened rapidly in M0 generation after natural homologous triploidization. The mutations were classified into 10 types, including 3 increased types of methylation-degree, 3 decreased types and 4 undecided types. The fragments of 22 methylation sites were sequenced and then searched through website. The results showed that the methylation mutation involved into the whole rice genome. The mutation trend was site-related and there were different mutation sites for different triploids, which foretelled that SARⅡ-628 would undergo different evolution ways after natural homologous triploidization.

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期刊信息
  • 《中国水稻科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国水稻研究所
  • 主编:程式华
  • 地址:杭州市体育场路359号中国水稻研究所内
  • 邮编:310006
  • 邮箱:cjrs@263.net
  • 电话:0571-63370278
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7216
  • 国内统一刊号:ISSN:33-1146/S
  • 邮发代号:32-94
  • 获奖情况:
  • 首届全国科技期刊评比二等奖,第二届全国优秀科技期刊评比三等奖,农业部浙江省优秀期刊,国家期刊奖百种重点期刊,百种中国杰出学术期刊,中国精品科技期刊,中国国际影响力优秀学术期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17826