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四川小麦地方品种AS1643中α/β-醇溶蛋白基因的序列分析
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S512.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]四川农业大学小麦研究所,都江堰611830, [2]四川农业大学生命科学与理学院,雅安625014
  • 相关基金:国家“863”项目(2003AA207100)、国家自然科学基金(30300219和30571163)、长江学者和创新团队发展计划(IRT0453)、高等学校全国优秀博士学位论文作者专项资金(200357)、四川省教育厅科研项目(2005B003)资助
中文摘要:

[目的]克隆四川小麦地方品种AS1643中的α/β-醇溶蛋白基因,并进行序列分析,探讨小麦AS1643的优良品质与其贮藏蛋白基因间的关系。[方法]采用PCR扩增的方法。[结果]从四川小麦地方品种AS1643中克隆到3个α/β-醇溶蛋白基因,即Gli-AS1643-1(GenBank No.DQ166376)、Gli-AS1642-2(GenBank No.DQ166377)和Gli-AS1643-3(GenBank No.DQ166378)。其中,Gli-AS1643-1和Gli-AS1643-2的编码区长度分别为873和852bp,可编码270和263个氨基酸残基的成熟蛋白。Gli-AS1643-3由于在编码区的第535~537位存在一个提前终止密码子,推测为不能编码成熟蛋白的假基因。序列比较显示Gli-AS1643-1、Gli-AS1643-2和Gli-AS1643-3分别与GenBank中的α/β-醇溶蛋白基因具有较高的一致性,且序列结构非常相似。它们的N-端氨基酸序列与各种α-、β-、γ-和α/β-醇溶蛋白的基本一致,但与ω-醇溶蛋白和低分子量谷蛋白亚基的明显不同。在N-端具有12肤串联重复序列特征,即紧密相关的5个脯氨酸框,在Ⅱ区和Ⅳ区具有类似于微卫星序列编码的2个多聚谷氨酰胺区域。在Gli-AS1643-2N-端存在与腹泻疾病相关的序列,C-端含有12型腺病毒感染序列。Gli-AS1643-1、Gli-AS1643-2和G1i—AS1643-3中都有可形成3个分子内二硫键的6个保守的半胱氨酸残基。[结论]小麦AS1643具有较好品质可能在于其贮藏蛋白基因间的相互作用等所致。

英文摘要:

[Objective] The objective was to clone α/β-gliadin genes from Sichuan wheat landrace AS1643, to analyze their gene sequences and to explore relationship between good quality of wheat AS1643 and its protein-storing gene. [Method] Method of PCR amplification was used in this study. [Result] The full coding regions (open reading frame, ORF) of three α/β-gliadin genes Gli-AS1643-1 (GenBank No.DQ166376), Gli-AS1643-2 (GenBank No.DQ166377) and GIi-AS1643-3 (GenBank No. DQ166378), were isolated from the genomic DNA of Sichuan wheat landrace AS1643. Among which, Gli-AS1643-1 and Gli-AS1643-2 were 873 bp and 852 bp, and could encode two mature proteins with 270 and 263 amino acid residues, respectively. Due to one stop codon in the 535-537 positions of its coding region, Gli-AS1643-3 was speculated to be a pseudogene. Multiple sequence alignment analysis suggested that Gli-AS1643-1, Gli-AS1643-2 and Gli-AS1643-3 have the higher similarity in their structure with the known α/β-gliadin genes in GenBank. N-terminal amino acid sequences of the three cloned genes were basically consistent with other α-, β-, γ- and α/β-gliadins, whereas it was clearly different with ω-gliadins and LMW-GS. N-terminal amino acid sequence was dodecapeptide tandem repeat feature with five more closely proline boxes. In Ⅱ and Ⅳ regions were two polyglutamine domains encoded by microsatellite-like sequences. Sequence active in celiac disease and adenovirus type twelve infection sequences were presented in N-domain and in C-domain of Gli-AS1643-2, respectively. The six conserved cysteine residues could form three intramolecular disulfide bonds in Gli-AS1643-1, Gli-AS1643-2 and Gli-AS1643-3, respectively. [ Conclusion ] Good quality of wheat AS 1643 could result form mutual effect of their storage protein or other factors.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620