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大熊猫Ⅰ类MHC基因的分离及分型技术的建立
  • ISSN号:0023-074X
  • 期刊名称:《科学通报》
  • 时间:0
  • 分类:S828.91[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]浙江大学生命科学学院,濒危动植物保护生物学教育部重点实验室,国家濒危野生动植物种质基因保护中心,杭州310058
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(2007CB411600)、国家林业局大熊猫专项基金(WH0627)和中央高校荩础研究基金资助
中文摘要:

濒危野生动物人工圈养繁育是防止或减缓物种走向灭绝的重要保护措施之一,已在诸多濒危动物的重引入工程及野生种群的复壮工程中,发挥了极为关键的作用.由于功能基因的多态性信息是制定圈养种群繁育计划的至关重要的遗传参数,因此,在脊椎动物基因组中一类具有高度多态性和在机体的免疫应答与环境适应中发挥关键作用的功能基因家族--主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC),便成为检测和评估濒危野生动物人工圈养种群免疫应答与环境适应能力的理想分子标记,并藉此制定科学的繁育计划.大熊猫是世界濒危野生动物保护的旗舰物种,而人工圈养种群的管理信息中尚缺乏MHC这一遗传参数.鉴此,本文通过构建大熊猫Ⅰ类MHC基因的克隆重叠群,共分离得到了6个Ⅰ类MHC功能基因,并将其分别命名为Aime-C,Aime-F,Aime-I,Aime-K,Aime-L和Aime-1906.组织表达检测和cDNA的全序列分析表明,Aime-C,Aime-F,Aime-I和Aime-L均具有广泛的组织表达和正常的外显子结构,为经典的Ⅰ类MHC基因;Aime-K和Aime-1906为特异性组织表达,且exon7的结构异常,为非经典的Ⅰ类MHC基因.本文进一步通过位点特异的单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)和测序分析,建立了大熊猫4个经典的Ⅰ类MHC基因exon2和exon3的特异性基因型分型方法.运用该方法对成都大熊猫繁育研究基地的大熊猫圈养种群进行遗传变异检测,发现Aime-F是单态位点,而Aime-C,Aime-I和Aime-L则呈现不同程度的多态性(3个基因的exon2均有4条等位基因,exon3分别有6条、5条和5条等位基因).此结果经由已知大熊猫圈养家系的分型验证,表明其准确有效,从而为同领域获取大熊猫Ⅰ类MHC基因的相关信息,提供了可靠的技术方法.

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期刊信息
  • 《科学通报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院
  • 主编:周光召
  • 地址:北京东黄城根北街16号
  • 邮编:100717
  • 邮箱:csb@scichina.org
  • 电话:010-64036120 64012686
  • 国际标准刊号:ISSN:0023-074X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1784/N
  • 邮发代号:80-213
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:81792