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鱇[鱼良]白鱼线粒体DNA控制区结构和种群遗传多样性分析
  • ISSN号:2095-8137
  • 期刊名称:《动物学研究》
  • 时间:0
  • 分类:Q959.468[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院昆明动物研究所,云南昆明650223, [2]中国科学院研究生院,北京100049
  • 相关基金:国家自然科学基金霞点项目(30730017):国家重点基础研究发展计划(2007CB411600)
中文摘要:

用特异性引物对鱇[鱼良]白鱼(Anabarilius grahami)DNA进行PCR扩增,获得了鱇[鱼良]白鱼线粒体DNA控制区基因全序列(930bp)。控制区T、C、A和G碱基组成为29.8%、22.5%、33.0%和14.7%。对照其他已报道的鱼类控制区结构,对鱇[鱼良]白鱼控制区结构进行了分析,识别了其终止序列区、中央保守区和保守序列区,找到了终止相关的序列TAS以及保守序列(CSB—F、CSB—D、CSB.1、CSB-2、CSB-3)。同时运用DNA分析软件对鱇[鱼良]白鱼一个驯养种群(中国科学院昆明动物研究所珍稀鱼类繁育中心)及两个自然地理种群(江川县明星鱼洞、江川县牛摩村)进行了遗传多样性分析。结果显示:两个自然种群存在较强基因交流,未出现遗传分化:人工驯养种群遗传多样性最高,种群复壮程度较好。

英文摘要:

The control region (D-loop) of Anabarilius grahami was amplified by PCR amplification with a pair of specific primers. The sequence with the complete nucleotide control region from A. grahami mitochondrial was cloned and directly sequenced. The length of this region (D-loop) contained 930bp nucleotides and the T, C, A and G contents were 29.8%, 22.5%, 33.0% and 14.7% respectively. The mtDNA control region ofA. grahami could be partitioned into three domains, namely, the termination associated sequence domain, the central conserved sequence domain and the conserved sequence block domain. The extended termination associated sequence (ETAS), two conserved blocks (CSB-F, CSB-D) in the central conserved sequence block domain and three conserved sequence blocks (CSBI, CSB2, CSB3) in the conserved sequence block domain were successfully identified and their homology compared with other fish. The genetic diversity analysis ofA. grahami from the Endangered Fish Breeding Center (EFBC) of the Kunming Institute of Zoology (KIZ), Mingxing Fish Cave (Jiangchuan), Niumo Village (Jiangchuan) was analyzed. The result indicated a very low genetic divergence between two natural populations, and the genetic diversity of the population from EFBC was much higher; they had recovered better than others.

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期刊信息
  • 《动物学研究》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院昆明动物研究所
  • 主编:
  • 地址:昆明市教场东路32号中国科学院昆明动物研究所
  • 邮编:650223
  • 邮箱:zoores@mail.kiz.ac.cn
  • 电话:0871-5199026 5113532
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-8137
  • 国内统一刊号:ISSN:53-1229/Q
  • 邮发代号:64-20
  • 获奖情况:
  • 2009年第三届云南省优秀期刊奖,1996年荣获云南省优秀科技期刊二等奖,2000荣获中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:10857