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蛇皮果基因组DNA提取及其RAPD条件优化
  • ISSN号:1673-923X
  • 期刊名称:《中南林业科技大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S789.5[农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]中国林业科学研究院热带林业研究所,广东广州510520
  • 相关基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项项目“蛇皮果栽后遮荫和灌溉技术研究”(编号:RITFKYYw2010一02);国家林业局948引进项目“蛇皮果栽培品种及配套栽培技术引进”(编号:2007-4.11)
中文摘要:

以蛇皮果顶梢嫩叶为材料,比较了CTAB法、改良CTAB法、CTAB-free法和SDS法对基因组DNA的提取效果,并对蛇皮果RAPD反应体系进行优化。结果表明,CTAB法、改良CTAB法和CTAB-free法均能提取出蛇皮果基因组DNA,其中NaCl浓度为5 m ol/L的改良CTAB法因可更有效地去除多糖及酚类物质,并能满足PCR扩增的要求而被认为是蛇皮果基因组DNA提取的最适方法;在15μL的PCR扩增体系中,Mg2+、dNTPs和Taq DNA聚合酶的最优浓度分别为1.4 mmol/L、0.12 mmol/L和0.12 U/μL;PC R反应程序的最适退火温度为39℃。

英文摘要:

By taking the tender leaves on top-shoots of Salacca edulis as tested materials, the extraction effects of CTAB, improved CTAB, CTAB-free and SDS on the genomic DNA of salak were investigated and compared. And the reaction system of salak RAPD was optimized. The results show that CTAB, improved CTAB, CTAB-free all could extracted out genomic DNA from salak, of them, the improved CTAB with NaC1 concentration of 5 mol/L could more effectively remove polysaccharides and polyphenols than the other two methods, and meet the requirement of PCR amplification, so it is the best method. The optimal concentrations of Mg2+, dNTPs, Taq DNA polymerase and the annealing temperature are 1.4 mmol/L, 0.12 mmol/L, 0.12 U/μL and 39 ℃ respectively for the PCR progress for salak.

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期刊信息
  • 《中南林业科技大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南省教育厅
  • 主办单位:中南林业科技大学
  • 主编:赵运林
  • 地址:湖南长沙市韶山南路498号
  • 邮编:410004
  • 邮箱:xb-csfu@163.com
  • 电话:0731-85623395 85623278
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-923X
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1470/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1999年被评为全国高优秀学报二等奖,湖南省高校优秀学报一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11201