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甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析
  • ISSN号:1674-7968
  • 期刊名称:《农业生物技术学报》
  • 时间:0
  • 分类:S188[农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193, [2]中国农业科学院研究生院,北京100081
  • 相关基金:国家重大基础研究发展规划(973)项目(No.2009CB119200)、国家自然科学基金(No.30871627)、国家科技支撑计划(No.2006BAD08A14)、公益性行业科研专项(No.nyhyzx07-050)和北京市农委政府购买科技服务项目(No.BJNY2007-03)资助.
中文摘要:

β-1,4内切葡聚糖酶是植物寄生线虫食道腺分泌的一类细胞壁降解酶,在植物线虫的侵染过程中具有重要的作用。以马铃薯腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)为材料,用RT-PCR和RACE方法,获得了β-1,4-内切葡聚糖酶基因的cDNA全长,并将该基因命名为Dd-eng-1b(GenBank登录号为FJ430142)。此cDNA全长序列为1640bp,包括1个1443bp的完整ORF,编码1含481个氨基酸的蛋白,其理论分子量为50.89kD,等电点pI为6.94。序列比对分析表明,含有糖基水解酶的保守结构域,属于纤维素酶第五家族成员,N端具有19个氨基酸残基组成的信号肽,C端含有细菌式样的纤维素结合域(CBDⅡ)。cDNA与基因组DNA重叠分析表明,此基因包含4个内含子,长度分别为36、76、187和344bp,切割点符合5'-GT……AG-3'的规律。系统进化树分析表明,该基因与细菌Bacillus subtilis和Erwina carotovora分泌的纤维素酶属于同一支,推测该基因可能来源于细菌的水平基因转移。

英文摘要:

β-1, 4-endoglucanase secretions from the oesophageal glands of plant-parasitic nematodes play important roles in infected plant. A new β-1, 4-endoglucanase gene, named Dd-eng-1b, was isolated from Ditylenchus destructor by RT-PCR and RACE. The full length cDNA of Dd-eng-1b consisted of 1 640 bp with a 1 443 bp ORF encoding a 481 amino acid protein (GenBank accession No. FJ430142). The putative protein with theoretic molecular weight was 50.89 kD and pI was 6.94. The sequence analysis indicated that this gene could be classified as a member of cellulose (glycosyl hydrolase family 5, GHF5) and had a 19 amino acid signal-sequence at N terminal and a high similarity to a bacterial type cellulose-binding domain Ⅱ at C terminal. Comparative analysis between cDNA and genomic showed that Dd-eng-1b contained four introns which length were 36, 76, 187 and 344 bp, respectively, demarcated by 5'-GT AG-Y in the slpice sites, and phylogenic analysis suggested that Dd-eng-1b had a strong homology to Bacillus subtilis and Etwina carotovora, which may be indicative of an ancient horizontal gene transfer from bacteria.

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期刊信息
  • 《农业生物技术学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中国农业大学
  • 主编:武维华
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农大生命科学楼1053
  • 邮编:100193
  • 邮箱:nsjxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733684 62731615
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-7968
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3342/S
  • 邮发代号:2-367
  • 获奖情况:
  • 在《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010年)...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15081