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细粒棘球蚴线粒体CO1基因的克隆与序列分析
  • ISSN号:1002-2694
  • 期刊名称:《中国人兽共患病学报》
  • 时间:0
  • 分类:R383.3[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室/内蒙古农业大学兽医学院,内蒙古呼和浩特010018, [2]内蒙古农牧业科学院兽医研究所,呼和浩特010031, [3]内蒙古医科大学基础医学院,呼和浩特010110
  • 相关基金:国家公益性行业(农业)专项资助(No.201103008,No.201303037)~~
中文摘要:

目的研究细粒棘球蚴(Echinococcus granulasus)种间遗传标记特点,为该虫种的分子分类学研究提供基础。方法在内蒙古地区从羊肝脏采集细粒棘球蚴,肝包虫病患者手术剥离囊包后,签署知情同意书,采集细粒棘球蚴。提取虫体DNA,扩增线粒体细胞色素氧化酶1(CO1)基因,将其克隆到PGM-T载体后,用PCR技术鉴定阳性菌落,并进行测序,运用DNAstar5.0软件计算序列间的相似性,计算遗传距离,同时,应用MEGA4.0软件的最大似然法(ML-Maximum Likelihood)和邻接法(NJ-Neighbor Joining)构建系统发育树,进行聚类分析。结果细粒棘球蚴DNA扩增出的羊株、人株CO1基因序列片段长度为936bp。同其他亲缘关系较近的属CO1基因序列比对:羊株、人株细粒棘球蚴CO1序列与黄花棘球绦虫的同源性最高,分别为91.9%、91.2%;羊株、人株细粒棘球蚴CO1序列与黄花棘球绦虫位于同一分支,自展值(Boostrap)最高,均为100%。羊株、人株细粒棘球蚴CO1序列所属分支与原头目的 Proteocephalus macrocephalus所属分支相隔较远。结论CO1基因序列稳定保守,无宿主特异性,可作为细粒棘球蚴理想的种间遗传标记。

英文摘要:

We investigated the inter-specific genetic marker of Echinococcus granulosus,which was used for further study in molecular classification.The genomic DNA of Echinococcus granulosus collected from the infected sheep and people in Inner Mongolia were extracted.The mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1(CO1)gene was amplified by PCR using universal primers,and then the PCR product was cloned into pGM-T vectors.The insert was sequenced successfully and compared with other cestodes sequences by DNAStar 5.0and MEGA 4.0.Results showed that the PCR product was 936 bp in length.Compared with other CO1 gene sequences of related cestodes,the homology among Echinococcus granulosus and Echinococcus canadensis were 91.9% and 91.2%.Echinococcus granulosus and Echinococcus canadensis were in the same branch,and bootstrap values(Boostrap)in the highest was 100%.Echinococcus granulosus affiliated branch of the original leaders of the branch belonged to Proteocephalus macrocephalus far apart.It suggested that the CO1 gene sequences were stably conservative and nonhost-specific,which can be used as an ideal species among Echinococcus granulosus genetic markers.

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期刊信息
  • 《中国人兽共患病学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国微生物学会
  • 主编:严延生
  • 地址:福州市津泰路76号
  • 邮编:350001
  • 邮箱:rsghb@fjcdc.com.cn
  • 电话:0591-87552018
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-2694
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1284/R
  • 邮发代号:34-46
  • 获奖情况:
  • 中国基础医学核心期刊,中国生物医学核心期刊,中国科学引文数据库列为来源期刊及统计源,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9000