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拟南芥在盐胁迫环境下SOS转录调控网络的构建及分析
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:Q253[生物学—细胞生物学]
  • 作者机构:[1]浙江大学农业与生物技术学院,杭州310029
  • 相关基金:农业部公益性行业科研专项(编号:200803034); 国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(编号:2008CB117002)资助
中文摘要:

研究拟南芥在高浓度盐处理环境下的基因调控网络,有助于了解其在盐胁迫环境下保持正常生长的防御机制。针对目前广泛研究的SOS(Salt Overly Sensitive)耐盐机制,文章整合公共数据库中盐胁迫相关的拟南芥基因组表达谱芯片,通过反向工程方法构建了拟南芥在盐胁迫状态下的SOS转录调控网络。所获得的调控网络包含70个盐胁迫相关且高度互作的互作基因,其中27个转录因子为主要调控节点。进而根据SOS核心基因的表达特性,所得调控网络内的不同表达模式得到了鉴别。

英文摘要:

Elucidating gene regulatory network of Arabidopsis thaliana under high salt treatment is crucial to understand the defense mechanism of maintaining normal growth rate. Here, an Arabidopsis Salt Overly Sensitive (SOS) transcriptional regulatory network under salinity stress was constructed using a reverse engineering method on published genome-wide expression profiles. In this study, the SOS regulatory network constructed contains 70 genes, of which 27 are highly interconnected transcription factors. According to the expression feature of key genes in SOS signaling pathway, distinct expression patterns of the regulatory network were identified.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270