给出了α型、β型、α/β型,多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律,提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别(分类)的方法,以蛋白质二级结构主序列三联体为参数,利用Mahalanobis距离方法对上述4种结构型的蛋白质进行识别,分类的总体准确率为81%;以二级结构主序列中六联体的频数构成蛋白质结构的多样性源,利用多样性增量极小化对上述4种结构型进行识别,分类的总体准确率为83%,同时也给出了对紧结构域的识别途径。