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基于线粒体 COI 基因部分序列的长江口虾虎鱼科鱼类系统分类
  • ISSN号:1000-6907
  • 期刊名称:《淡水渔业》
  • 时间:0
  • 分类:S917.4[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡214182, [2]中国水产科学研究院东海水产研究所,上海200090
  • 相关基金:长江水环境教育部重点实验室开放课题(YRWEE201106);公益性行业(农业)科研专项(201203065);长江口中华鲟自然保护区专项;上海市青草沙水库临近水域生态修复专项
中文摘要:

对采自长江口的7种虾虎鱼(Gobiidae)19个个体的线粒体COI基因进行测序,其他6种虾虎鱼的相应序列从Genbank中获得。序列分析结果显示7种虾虎鱼的COI基因部分序列密码子的第一位碱基的GC碱基含量最恒定,第三位碱基的GC含量最高,平均A+T的含量要高于G+C的含量,与多种鱼类的COI基因的碱基特点相似。运用MEGA5.0计算13种虾虎鱼的种间遗传距离,表明拉氏狼牙虾虎鱼(Oxyurichthy tentacularis)与孔虾虎鱼( Chaeturichthys stigmatias)归属于近盲虾虎鱼亚科,根据种间遗传距离与系统发育树的结构特征推测,触角沟虾虎鱼和矛尾虾虎鱼可能具有共同的起源。

英文摘要:

A total of nineteen specimens of seven species of Gobiidae derived from the Yangtze River were couected to se -quence mitochondrial COI genes.Sequences from homologous regions of six other species of this family were gathered from Genbank.The results showed that the most constant GC content was in the first base of codon and the highest GC content existed in the third base of codon .The average content of A +T was higher than the average content of G +C.The feature was similar to most fishes .Comparing the COI gene of thirteen species of Gobiidae with MEGA 5.0 , the taxonomic status of Odontamblyopus lacepedii and Trypauchen vagina were proved legitimately .The genetic distance between species and the structure feature of Phylogeny tree indicated the same origin of Oxyurichthy tentacularis and Chaeturichthys stigmatias.

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期刊信息
  • 《淡水渔业》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国水产学会 中国水产科学研究院长江水产研究所 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
  • 主编:陈大庆
  • 地址:湖北省武汉市东湖新技术开发区武大园一路8号
  • 邮编:430223
  • 邮箱:dsyy@chinajournal.net.cn
  • 电话:027-81780185
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6907
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1138/S
  • 邮发代号:38-32
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11619