位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
刀鲚Δ6脂肪酸去饱和酶cDNA的克隆与组织表达检测
  • ISSN号:1000-2030
  • 期刊名称:《南京农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S96[农业科学—水产养殖;农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学无锡渔业学院, [2]中国水产科学研究院淡水渔业研究中心、农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室,江苏无锡214081
  • 相关基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费院级专项(2013A0903);国家科技支撑计划项目(2012BAD26B05);国家公益性行业(农业)科研专项(201203065);江苏省水产三新工程重大专项(DZ2012-1)
中文摘要:

利用RT-PCR和RACE技术获得刀鲚(Coilia nasus)Δ6脂肪酸去饱和酶(Δ6 fatty acyl desaturase,FAD6)的全长cDNA序列2 032 bp,开放阅读框(ORF)为1 338 bp,编码445个氨基酸。其具有3个保守的组氨酸簇(HDXGH、HXXHH和QXXHH)、2个跨膜区和含亚铁血红素结合基序(HPGG)的细胞色素b5结构域等典型的Δ6脂肪酸去饱和酶结构特点。氨基酸同源性分析显示,刀鲚FAD6与海鳗(Muraenesox cinereus)和军曹鱼(Rachycentron canadum)等海水鱼类的相似性达75%~79%,而与淡水鱼类的相似性较低。系统进化分析也显示,其与海水鱼类的亲缘关系较近。荧光定量PCR检测发现该基因在刀鲚脑和肠中高表达,肌肉和肝脏相对高表达,心脏、肾脏和鳃低表达。

英文摘要:

The full-length cDNA of Δ6 fatty acyl desaturases(FAD6) of Coilia nasus,which was involved in the biosynthesis of highly unsaturated fatty acids(HUFA),was cloned by RT-PCR(reverse transcription polymerase chain reaction) and RACE(rapidamplification of cDNA ends) methods. The results revealed that the FAD6 cDNA was 2 032 bp,including an ORF(open reading frame) of 1 338 bp specified a protein of 445 amino acids,which contained three histidine-rich regions and two putative transmembrane domains. The deduced amino acid sequence shared 75%-79% identity with that in Muraenesox cinereus and Rachycentron canadum,and low similarity of freshwater fish. Actually,it was consistent with the results of phylogenetic analysis. The tissue-specific expressions of FAD6 mRNAs were detected in C. nasus. A high expression was observed in the brain and intestine, while relatively high expression was encountered in muscle and liver,and a weak expression in the heart,kidney and gill.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《南京农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:郑小波
  • 地址:江苏省南京市卫岗1号
  • 邮编:210095
  • 邮箱:nauxb@njau.edu.cn
  • 电话:025-84395214
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2030
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1148/S
  • 邮发代号:28-53
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国优秀科技期刊,第二届江苏省十佳科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22558