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三叶青两个肌动蛋白基因片段的克隆及其分析
  • ISSN号:1000-0852
  • 期刊名称:《水文》
  • 时间:0
  • 分类:Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]杭州师范大学生命与环境科学学院,浙江杭州310036
  • 相关基金:浙江省药用植物种质改良与质量控制技术重点实验室开放项目(201302)
中文摘要:

根据GenBank中登录的植物肌动蛋白保守序列设计1对引物,对三叶青的块根进行RT-PCR,在1次扩增中得到2个不同的肌动蛋白基因片段,分别命名为ThAct1和ThAct2.测序结果显示:ThAct1基因片段长度为867bp,编码252个氨基酸;ThAct2基因片段长度为1 079bp,编码152个氨基酸.经Blast分析,ThAct1和ThAct2基因均属于NBD_sugar-kinase_HSP70_actin superfamily家族,与其它物种Actin基因序列和编码的蛋白质均具有同源性.RT-PCR结果初步表明:在茎、普通根和块根中ThAct1和ThAct2基因的表达未见差异;但在叶中,ThAct1的表达稍强,而ThAct2的表达稍弱.另外,在茎、普通根和块根中,ThAct1表达比ThAct2强;但在叶中ThAct1表达比ThAct2弱.结果为分析肌动蛋白基因在三叶青块根发育中的功能奠定了基础;获得的肌动蛋白也可以作为内参基因,在三叶青功能基因组的研究中用于其它基因的定量表达分析.

英文摘要:

According to the conserved sequence of plant actin genes in GenBank database,one pairs of primers are designed.Two different actin gene fragments,named as ThAct1 and ThAct2,are amplified in one RT-PCR reaction from calabash-shaped root of Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg.The results indicate that the length of ThAct1 is 867 bp encoding 252 amino acids,and the length of ThAct2 is 1 079 bp encoding 152 amino acids.By Blast analysis,both ThAct1 and ThAct2 genes belong to the NBD_sugar-kinase_HSP70_actin superfamily,and are homology with other species in Action gene sequence and the protein of code.The RT-PCR analysis shows that the expression of ThAct1 and ThAct2 has no difference in the stem,ordinary root and calabash-shaped root,ThAct1 in the leaf is slightly stronger than ThAct2,while ThAct1 in the stem,ordinary root and calabash-shaped root is slightly high but weak in the leaf.The actin gene obtained can be used as a reference gene for the quantitative expression analysis of other genes in the genome of Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg.

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期刊信息
  • 《水文》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国水利部
  • 主办单位:水利部水利局
  • 主编:邓坚
  • 地址:北京市白广路二条2号
  • 邮编:100053
  • 邮箱:J.hyd@mwr.gov.cn
  • 电话:010-63203599
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-0852
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1814/P
  • 邮发代号:2-430
  • 获奖情况:
  • 《CAJ-CD规范》执行优秀奖
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:10092