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超分支滚环扩增法检测传染性脾肾坏死病毒
  • ISSN号:1003-1111
  • 期刊名称:《水产科学》
  • 时间:0
  • 分类:S917.1[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]宁波大学生命科学与生物工程学院,浙江宁波315211, [2]浙江出入境检验检疫局微生物实验室,浙江杭州310012
  • 相关基金:长江学者和创新团队发展计划(IRT0734); 浙江省科技厅重点项目(2008C22049)
中文摘要:

用超分支滚环扩增法检出传染性脾肾坏死病毒。超分支滚环扩增法包括锁式探针的连接及超分支滚环扩增法扩增两部分,通过研究锁式探针的最佳连接体系和连接条件,并进行超分支滚环扩增法反应条件的优化,得出的本研究最适反应条件为:锁式探针在T4 DNA连接酶作用下37℃连接20 min,接下来的超分支滚环扩增法在Bst DNA聚合酶大片段作用下61℃反应40 min,即能够实现靶序列的有效检出。灵敏度试验表明,超分支滚环扩增法所能检测到的最低模板量接近1 copy。在4种病毒中进行的特异性试验表明,本方法能够保证对传染性脾肾坏死病的特异性检测。

英文摘要:

In this paper,a 60-min hyper-branched rolling circle amplification(HRCA) method was established for rapidly and simply visual detection of infectious spleen and kidney necrosis virus(ISKNV) as an important viral pathogen in aquaculture.The padlock probe consists of a universal linking sequence and two target complementary regions at 5' and 3' ends,which was designed based on the DPOL sequence of ISKNV.Detection system of HRCA was established and optimized with the ISKNV detection limit of 1 copy.The results showed that the HRCA method had advantages of high sensitivity,and speed and equipment-independent outcompeting the standard PCR-AGE for specifically detecting the low levels of ISKNV DNA,which can be useful in field as a routine diagnostic tool.

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期刊信息
  • 《水产科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:辽宁省海洋与渔业厅
  • 主办单位:辽宁省水产学会
  • 主编:周遵春
  • 地址:大连市沙河口区黑石礁街50号辽宁省海洋水产研究院
  • 邮编:116023
  • 邮箱:shchkxbjb@yahoo.com.cn
  • 电话:0411-84679512
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-1111
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1110/S
  • 邮发代号:8-164
  • 获奖情况:
  • 中文水产渔业类核心期刊,全国农业系统期刊,全国...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:12194